شیرخروس امپراتور بچه پنچی و سمی از چالش نهایی خود آغاز می شود! در دمای سی درجه زیر صفر، زمستان به قطب جنوب رسیده است. قطب جنوب که سردترین ناحیه ی یخچالی جهان است، به خاطر سرمای شدید رها شده است. ساکنان اصلی اینجا امپراتورهای پنگویان هستند که به استقبال زندگی های تازه آمده اند. با وجود عشق و محبت مادری و پدری، پنچی و سمی از تخم شان بیدار می شوند. پنچی، بچه پرخور و مزاحم شماره یک قطب جنوب، و سمیِ زیبا که بیش از هر چیز آغوش پدر را دوست دارد، به دوستان بزرگی تبدیل می شوند. روزی پدر سمی برای یافتن او به دریا می رود. سمی تنها و سرد و گرسنه در آستانه مرگ باقی می ماند و پنچی برای کمک به سمی با تمام وجود تلاش می کند. آیا پنچی و سمی قادرند بر مشکلات بی شمار فائق آیند و پنگوئن های امپراتور کاملاً بزرگ شوند؟